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Séquençage à haut débit pour l'acquisition de données génomique chez le chêne pé - Bordeaux-Aquitaine Organisme : UMR BIOGECO 1202 INRA - Bordeaux-Aquitaine Intitulé : Séquençage à haut débit pour l'acquisition de données génomique chez le chêne pé - Bordeaux-Aquitaine Objet...
INRA - Bordeaux-Aquitaine 33883Villenave-d'Ornon
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Séquençage à haut débit pour l'acquisition de données génomique chez le chêne pé - Bordeaux-Aquitaine

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Marché public ou privé
Référence du marché : 222988

Etat : Première publication
Publié dans :
SOURCEWEB (19/09/12)

Organisme : UMR BIOGECO 1202 INRA - Bordeaux-Aquitaine

Intitulé : Séquençage à haut débit pour l'acquisition de données génomique chez le chêne pé - Bordeaux-Aquitaine

Objet : Il s'agira plus précisément de séquencer le génome de deux génotypes de chêne pédonculé. La taille du génome du chêne est estimée à 750Mb/C. Génotype n° 1 : séquençage complet du génome. Génotype n°2 : séquençage de 6 échantillons d'ADN collectés sur un même individu de chêne pédonculé afin d'identifier des mutations somatiques. Pour chaque échantillon nous souhaitons une couverture de l'ordre de 20X. L'ADN génomique sera extrait par l'UMR Biogeco. La société retenue aura la charge de construire les banques d'ADNg et d'effectuer le séquençage. La couverture de séquençage sera suffisante pour permettre la reconstruction du génome et l'identification des polymorphismes. Un génome de référence pour le chêne pédonculé est disponible. L'analyse bioinformatique des données de séquençage sera effectuée par les chercheurs de l'UMR BIOGECO.

Description : Adresse de livraison : INRA UMR BIOGECO 1202 Equipe EGF 69, route d'Arcachon 33612 CESTAS Cedex

Critères attribution : - valeur technique de l'offre - prix des prestations - délai de livraison, - qualité de la garantie et du SAV L'administration se réserve le droit de négocier.

Contact principal : Contact technique: Grégoire LE PROVOST INRA UMR BIOGECO 1202 69, route d'Arcachon 33612 CESTAS Cedex Fax : 05-57-12-27-73 Courriel : leprovost_at_pierroton.inra.fr

Contact secondaire : Contact administratif: Florence LE PIERRES Gestionnaire INRA UMR BIOGECO 1202 69 Route d'Arcachon 33612 Cestas Tél: 05 57 12 28 43 Fax: 05 57 12 28 81 Courriel: florence_at_pierroton.inra.fr

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