Avis d’attribution de marché
Résultats de la procédure de marché
Services
Section I: Pouvoir adjudicateur
Section II: Objet
Prestations de séquençage
L'objet du présent accord-cadre est de produire des ressources génétiques et des ensembles de données pour les espèces Timema. Il comprend le reséquençage de génomes entiers (WGRS), la production de plusieurs génomes de référence, le séquençage de mécanismes épigénétiques et le génotypage par séquençage (ddRAD) de phasmes du genre Timema. Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Reséquençage de génomes entiers de phasmes du genre Timema
CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
Cette prestation vise à imputer les séquences du génome entier d'individus du genre Timema en utilisant un reséquençage profond (10x) du génome entier d'individus, afin de prédire la séquence du génome entier d'autres individus avec un séquençage à couverture 0,5x. Le titulaire assurera la préparation des bibliothèques et le séquençage de ces bibliothèques. Les extractions d'ADN seront envoyées par transporteur en différents lots d'une centaine d'échantillons à la fois.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Production de génomes références d’espèces de phasmes du genre Timema
CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
Le présent lot a pour objet le séquençage de génomes de référence avec un assemblage à l'échelle chromosomique et avec résolution des haplotypes. Nous demandons plusieurs génomes de référence pour différents morphes (avec différents motifs dorsaux) dans différentes espèces du genre Timema.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Séquençage de mécanismes épigénétiques de phasmes du genre Timema
CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
La prestation vise à réaliser des tests épigénétiques chez T. cristinae à partir de populations de plantes hôtes différentes – qui définissent les écotypes. Nous prévoyons d'obtenir des données pour des spécimens de différentes plantes hôtes sur :
1) Le statut de méthylation de l'ADN en utilisant la technique WGBS ;
2) La carte d'accessibilité de la chromatine à haute résolution en utilisant la technique ATAC-seq;
3) L’organisation tridimensionnelle de la chromatine et une carte génomique des interactions entre les loci utilisant la technique Hi-C;
4) Carte des modifications des histones à l'aide de ChIP-seq;
5) Des modèles d'expression utilisant la technique RNA-seq;
6) Évaluer la structure génétique qui sous-tend ces structures épigénétiques à l'aide du WGS. Nous fournirons les tissus d'insectes et le fournisseur de services se chargera d'effectuer les différents traitements (i.e., bisulfite, ATAC, capture de la conformation de la chromatine) suivi d'un séquençage à haute résolution.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Génotypage par séquençage des librairies hautes diversités de phasmes du genre Timema
CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175
1919, Route de Mende
34293 MONTPELLIER
L’objet du présent contrat est de génotyper par séquençage des individus de l'espèce Timema cristinae. Nous fournirons au titulaire des librairies prêtes. Le prestataire réalisera le séquençage de ces librairies.
Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Section IV: Procédure
Section V: Attribution du marché
Reséquençage de génomes entiers de phasmes du genre Timema
Section V: Attribution du marché
Production de génomes références d’espèces de phasmes du genre Timema
Section V: Attribution du marché
Séquençage de mécanismes épigénétiques de phasmes du genre Timema
Section V: Attribution du marché
Génotypage par séquençage des librairies hautes diversités de phasmes du genre Timema
Section VI: Renseignements complémentaires
Les recours susceptibles d’être introduits à l’encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d’introduction de ces recours figurent à la rubrique VI.4.3 de l’AAP (formulaire européen).
La date de signature du marché pour le lot n°1 est le 12.12.2023 ; pour le lot n°2, la signature est en date du 13.12.2023 et pour le lot n°4, la signature est en date du 14.12.2023.
La date de notification de l'ensemble des lots aux titulaires est le 14.12.2023.
Le présent avis d'attribution correspond à l'accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-et-Garonne (CE, Ass., 4 avril 2014, n°358994).
Le contrat est consultable dans le respect des secrets protégés par la loi n°78-753 du 17 juillet 1978 codifiée dans le livre III du code des relations entre le public et l'administration, sur place à l'adresse indiquée à la rubrique 1.1, après une demande écrite adressée par courriel (DR13.achats@dr13.cnrs.fr) au service financier et comptable de la délégation et uniquement sur prise de rendez-vous du lundi au vendredi de 9:30 à 11:30 et de 14:30 à 16:00, hors jours fériés et jours de fermeture du site.
