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Analyses sur puces ADN Affymetrix et Agilent Organisme : CNRS Délégation 12 Bénéficiaire de l'achat : Centre d'immunologie de Marseille-Luminy 163 Avenue de Luminy Case 906 13288 Marseille Cedex 09 Nature : Services
CNRS Délégation 12
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Analyses sur puces ADN Affymetrix et Agilent

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Marché public ou privé
Référence du marché : 999062

Etat : Première publication
Publié dans :
SOURCEWEB (06/03/14)

Organisme : CNRS Délégation 12

Bénéficiaire de l'achat : Centre d'immunologie de Marseille-Luminy 163 Avenue de Luminy Case 906 13288 Marseille Cedex 09

Nature : Services

Intitulé : Analyses sur puces ADN Affymetrix et Agilent

Domaine : CHIMIE ET BIOLOGIE : SERVICES

Sous-domaine :

Zone géographique de livraison ou d'exécution : Provence

Date de publication : 05/03/14

Adresse de livraison ou d'exécution : CNRS CIML 163 avenue de Luminy case 906 13288 MARSEILLE CEDEX 09

Date prévisionnelle de livraison :

Etat des matériels :

Description technique : Cet appel d’offre a pour objet la réalisation d’analyses sur puces ADN pangéomiques Affymetrix et Agilent à partir d’ARN total de cellules eucaryotes fourni en quantités très limitées, pour le Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy. La spécificité technique du projet réside dans la quantité très limitée de matériel de départ: 2000 cellules ou ~200 pg d’ARN total pour les échantillons les plus limitants, 25 ng d’ARN total pour les autres échantillons. Description des prestations attendues et spécifications techniques: Les cRNA devront être générés par une technique linéaire d’amplification. Afin de permettre une comparaison des résultats avec ceux déjà établis dans le laboratoire et avec les banques de données publiques, les plates-formes qui devront être utilisées seront : 1) soit des puces Affymetrix «3’IVT» («Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array» pour la souris et «Affymetrix Human Genome U133 PLUS 2.0» pour l’homme, 2) soit des puces Affymetrix «Whole-Transcript Expression Analysis»(«Mouse Gene ST 1.0 chips» pour la souris et «Human Gene 1.0 ST Array» pour l’homme), 3) soit des puces Agilent. Les séries seront constituées de 8 à 16 échantillons minimum, qui devront être traités en parallèle, simultanément, afin d’éviter les effets de lots, et de limiter le plus possible la variabilité technique liée à des différences dans les conditions de traitement des échantillons. Pour les échantillons fournis en quantité très limitée (

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