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Deux projets de séquençage Illumina - Nancy Organisme : UMR 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes INRA - Nancy Intitulé : Deux projets de séquençage Illumina - Nancy Objet : LOT1:Projet de séquençage mRNA-Seq po...
INRA Nancy 54280Champenoux
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Deux projets de séquençage Illumina - Nancy

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Marché public ou privé
Référence du marché : 548335

Etat : Première publication
Publié dans :
SOURCEWEB (05/04/13)

Organisme : UMR 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes INRA - Nancy

Intitulé : Deux projets de séquençage Illumina - Nancy

Objet : LOT1:Projet de séquençage mRNA-Seq pour 8 échantillons plante/champignon en Illumina HiSeq (paired-end 2x100pb). Le projet comprend la construction de 8 banques à partir d'ARN totaux (1 microgramme fourni par échantillon) et le séquençage à raison de 4 échantillons maximum (4 tags multiplexés) par canal Illumina soit 2 canaux Illumina au total. LOT2: Projet de re-séquençage génomique pour 15 isolats d'une espèce de champignon pour laquelle un génome de référence est disponible (125 Mbp) en Illumina HiSeq (paired-end 2x100pb). Le projet comprend la construction de 15 banques à partir d'ADN génomique et le séquençage sur un canal Illumina HiSeq pour une couverture de 15-20x par banque.

Description : :Cf. Objet détaillé

Critères attribution : Prix séquençage et construction de banques, délai de livraison proposé, quantité d'ARN et ADN à fournir.

Contact principal : LOT1:Annegret Kohler kohler_at_nancy.inra.fr LOT2:Claude Murat claude.murat_at_nancy.inra.fr

Contact secondaire : Francis Martin fmartin_at_nancy.inra.fr

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