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Runs 454 Titanium - Nancy Organisme : UMR 1136 Interactions Arbres Microorganismes INRA - Nancy Intitulé : Runs 454 Titanium - Nancy Objet : Runs 454 Titanium (3 RUNS de 1 million de reads/run) ave...
INRA - Nancy 54280Champenoux
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Runs 454 Titanium - Nancy

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Marché public ou privé
Référence du marché : 222986

Etat : Première publication
Publié dans :
SOURCEWEB (19/09/12)

Organisme : UMR 1136 Interactions Arbres Microorganismes INRA - Nancy

Intitulé : Runs 454 Titanium - Nancy

Objet : Runs 454 Titanium (3 RUNS de 1 million de reads/run) avec créations de 8 à 24 banques (par run). Chaque banque comprendra des fragments amplicons (10 à 20 produits PCR tags) et nécessitera la libation d'un second étiquetage (MID) à l'échelle des libraires. Le schéma de tagging sera discuté avec le prestataire. L'entreprise aura a sa charge la ligation des adaptateurs, le séquençage et les analyses qualité et bioinformatique (demultiplexage, recherche des tags et réorientation des séquences). Le demultiplexage reposera sur un schéma de tagging double (deux niveaux): MID-1 de pré-libraries (réalisé par le client), et étiquetage des libraires par le prestataire (8 à 24 libraires par run). Il s'agit d'un projet de Metagenomique regroupant plusieurs pools PCR (analyse des bactéries, nématodes, arthropodes,champignons... du sol)

Description : Confère objet détaillé

Critères attribution : Qualité du schéma de tagging (critère technique) et du demultiplexage (et analyses bioinformatiques), durée de livraison et tarifs

Contact principal : Marc BUEE buee_at_nancy.inra.fr

Contact secondaire : Annegret KOHLER kohler_at_nancy.inra.fr

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