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Séquençage haut débit Illumina Organisme : CNRS Délégation 13 Bénéficiaire de l'achat : Centre de recherche de biochimie macromoléculaire Nature : Services
CNRS Délégation 13
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Séquençage haut débit Illumina

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Marché public ou privé
Référence du marché : 743976

Etat : Première publication
Publié dans :
SOURCEWEB (26/06/13)

Organisme : CNRS Délégation 13

Bénéficiaire de l'achat : Centre de recherche de biochimie macromoléculaire

Nature : Services

Intitulé : Séquençage haut débit Illumina

Domaine : GAZ ET PRODUITS POUR LA CHIMIE, LA BIOCHIMIE, LA BIOLOGIE ET SERVICES CONNEXES

Sous-domaine : SERVICES EN CHIMIE, BIOCHIMIE, BIOLOGIE

Zone géographique de livraison ou d'exécution : Languedoc Roussillon

Date de publication : 26/06/13

Adresse de livraison ou d'exécution : CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CRBM UMR 5237 1919 Route de Mende 34293 MONTPELLIER CEDEX 5

Date prévisionnelle de livraison : 01/08/13

Etat des matériels : Neuf uniquement

Description technique : Le projet vise au séquençage d'ARN polyA+ (RNA-seq) de différentes espèces d’invertébrés marins (%GC=40) par technologie Illumina HiSeq. Le sens de transcription doit être identifiable dans les résultats de séquence. Le projet comporte deux volets : Séquençage de 12 échantillons fournis sous la forme d’ARN total. Il s'agit de réaliser pour chaque échantillon d’ARN total: 1) une librairie de fragments ADNc orientés (permettant de connaître le sens de transcription) à partir d’ARN messagers poly A+ (taille d’inserts env. ≥ 200bp); 2) de multiplexer ces échantillons pour obtenir autour de 30 millions de séquences "paired-end" de 50 bases (PE50bp) pour chacun d'entre eux. Les séquences seront mises à disposition par site ftp ou par envoi d'un disque dur. Aucune analyse bioinformatique n'est requise du prestateur de service (hors contrôles qualité classiques). Les paramètres techniques importants pour le choix du prestataire sont: 1) la capacité à réaliser des librairies de fragments orientés à partir de quantités relativement limitées de matériel (2μg ARN total) 2) la qualité du séquençage, 3) un délai de réalisation inférieur à un mois à compter de la réception des échantillons.

Conditions d'exécution du marché : Marché à bon de commande

Modalités de participation :


Pièces à fournir : Devis

Modes de transmission autorisés : Courrier électronique, Courrier postal ou remise en main propre Les réponses à cet appel d’offre doivent indiquer outre le devis: a) La technologie précise utilisée pour produire les banques b) La taille des inserts produits c) Les contrôles qualité fournis après fabrication des banques et après séquençage. d) Le délai de réalisation.

Date limite de réception : 05/07/13 12:00

Autres renseignements : Les offres doivent être envoyées simultanément à messieurs LEMAIRE et PIETTE.

Contacts :

Expert Technique / Acheteur :

Nom : LEMAIRE Patrick

Adresse : CNRS CRBM UMR 5237 1919 route de Mende 34293 MONTPELLIER CEDEX 5

Téléphone : 06 25 10 13 30

Fax :

Courriel : patrick.lemaire@crbm.cnrs.fr


Contact Administratif :

Nom : MASMEJEAN Ghislain

Adresse : CNRS CRBM UMR 5237 1919 route de Mende 34293 MONTPELLIER CEDEX 5

Téléphone : 04 34 35 95 75

Fax :

Courriel : ghislain.masmejean@crbm.cnrs.fr


Expert Technique / Acheteur :

Nom : PIETTE Jacques

Adresse : CNRS CRBM UMR 5237 1919 route de Mende 34293 MONTPELLIER CEDEX 5

Téléphone : 04 34 35 95 63

Fax :

Courriel : jacques.piette@crbm.cnrs.fr



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